NPWP atau tidak ?

Rekans,

Kalau ada perusahaan posisi di kota A dan mempunya warehouse di kota B dan kota C, dan kewajiban perpajakan daerah seperti PPh 21 dll berjalan artinya di kota B & C terdaftar NPWP sesuai kode wilayah dan belakangnya 001. apakah :

1. Perlu mendaftar NPWP khusus untuk kota B & C (klo KPP setempat mendatangi dan menyampaikan Surat Kewajiban Pendaftaran PKP) ?
2. Kenapa KPP setempat memakai dasar hukum PER20 PJ 2016 ? dengan alasan ada kegiatan perdagangan ? sedangkan perusahaan di kota A adalah manufaktur ?

Please advice.

ya benar seperti itu, bedanya B sudah ada 001 sedangkan C masih terpusat di A, please advice.